Nat Biotechnol:研究不能多次重复?可能是HeLa细胞系“变”了

2022-02-14 16:08:16 来源:
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HeLa巨噬细胞已经在各种类型的许多物理室养成了近70年,并且长期以来被视为是无限用水的不渐变的相同巨噬细胞。然而,2年初18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新的研究者说是明,巨噬细胞在相异物理室相互间依赖于不小歧异,这造成了了对巨噬细胞系研究者经常性的质疑。“我很吃惊看得见这项研究者,但在某种意义上我并不感到惊讶,”斯隆史蒂芬妮可癌症区域内的分子生态学家Prasad Jallepalli说是,他没有直接参与这项研究者。这并不是HeLa巨噬细胞系自发端以来第一次注意到多样化的报道:时至今日,其他研究者小组也证明了HeLa巨噬细胞生物体本体相互间在原核生物和RNA表达的显着歧异。这项最新的研究者首次全面分析了各种HeLa生物体本体的遗传生物体(相异SP的HeLa巨噬细胞系生活在各种类型的各个物理室),并且首次证明遗传异质性造成了了核糖体表达和遗传基因的推移。HeLa巨噬细胞“渐变了”?在这项研究者当中,研究者医务人员从6个国内的13个物理室收集了14份HeLa结果显示,并在相同的物理室必要条件下透过养成。他们首先量化了基因拷贝数生物体,揭示了它们基因组相互间的显着歧异。结果找到,HeLa生物体本体相互间,特别是CCL2和Kyoto生物体本体相互间依赖于着不小的异质性。进一步的分析说是明,许多这些遗传歧异转化为mRNA导致的推移,并且在较小程度上转化为核糖体数量级的推移。研究者医务人员统计数据说是,HeLa CCL2和Kyoto巨噬细胞系的转录组和核糖体组谱彼此相互间的歧异,就像来自两种相异特性组织的癌巨噬细胞系相互间的歧异一样。HeLa生物体本体在养成过程当中生长速度也相异,一些巨噬细胞群能够17.5时长才能加倍,而另一些巨噬细胞在相同的养成必要条件下能够话费高达32时长。它们对沙门氏菌病毒的反应也各有相异:与其他两种渐变本体相对,一种渐变本体对病毒的敏感性较低,研究者医务人员将其归因于低水平的核糖体核酸,这种核糖体核酸在生物体进入宿主巨噬细胞当中起发挥作用。在一项之外的物理当中,研究者小组通过养成巨噬细胞系三个年初,来观察HeLa生物体本体的线粒体到底会随着时间发生推移。研究者医务人员记过确了更早巨噬细胞和晚期巨噬细胞相互间线粒体歧异差不多6%。苏黎世联邦理工分子系统生态学研究者所的Ruedi Aebersell客座教授是该研究者的合着者,他说是,“即使在同一个物理室里,这些巨噬细胞的歧异和推移速度也是并不无与伦比的。”他估计,如果一个研究者生在项目开始时用HeLa巨噬细胞系要用了一个物理,并在六个年初后被要求重复这个物理,他们意味著会得到相异的结果。关于研究者当中的“可复制性危机”的发表意见大多数集当中在物理设计、数据分析方面的有缺陷,以及作为主要传动装置因素的受废水或张贴确标签的巨噬细胞系。但是Aebersell视为,HeLa巨噬细胞系和癌巨噬细胞系的生态学歧异意味著是关键。为什么会“渐变”?斯坦福大学的巨噬细胞生态学家Tim Stearns视为有几个意味著的原因可以解释为什么巨噬细胞系在短时间内养成会有发生推移。首先,HeLa巨噬细胞是已知基因组不稳定的癌巨噬细胞,因此很意味著随时间随机基因型。此外,它们还会在物理室当中受到各种生长必要条件的影响,这意味著会无可避免巨噬细胞进化显露独特的特征。例如,他说是,动物巨噬细胞的养成都有将其养成到充满一个养成皿为止,从养成皿当中抽取一部分巨噬细胞,然后将它们摆放在另一个养成皿当中生长,这一过程叫做分离。“每个人要用这件过确的方式也都有点相异,”他问道。最新的这些找到,对于人类养成巨噬细胞的研究者结果的解释和重现性有一定的意义。Aebersell和他的同过确在博士论文当中提显露了几个具本体的提供商。首先,研究者医务人员一定会使用癌巨噬细胞系的更早传代,并确保在同一巨噬细胞系的相异结果显示当中重复同一巨噬细胞系的物理。更重要的是,生态学家一定会清楚地统计数据他们在给定的研究者当中使用的巨噬细胞系生物体本体。
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